O brasão do Instituto traz os alguns elementos importantes da espiritualidade de São Josemaria Escrivá:

• As cores do brasão foram inspiradas na bandeira da Espanha, pátria de São Josemaria.
• As pegadas lembram a vocação de São Josemaria, que sentiu-se chamado por Deus ao contemplar as pegadas na neve deixadas por um frade carmelita.
• O burrico lembra o título que São Josemaria atribuia a si mesmo: “burrico sarnento”. E certa vez, em oração, o Senhor lhe segredou: “Um burrinho foi o meu trono em Jerusalém”.
• A rosa lembra a presença da Virgem Maria na vida de São Josemaria. Certa vez ela lhe deu um sinal amoroso e decisivo através de uma pequena rosa.
• O bonde alude à experiência de oração vivida por São Josemaria, na qual ele, no vagão de um bonde, mergulhou no mistério da paternidade divina e da sua filiação em relação a Deus.
• As flores de lis ao redor do escudo é um símbolo cristão que remete aos Sermões sobre o Cântico dos Cânticos de São Bernardo de Claraval que diz: “No céu, os eleitos são como lírios”. Na arte heráldica, o lírio foi estilizado e se tornou a flor de lis. As três pétalas da flor de lis representam três virtudes: as duas pétalas do lado correspondem às virtudes da ciência e da coragem e a pétala voltada para cima representa a fé. No brasão do Instituto, as flores de lis representam os santos que estão no céu que intercedem, ensinam e acompanham a missão do Instituto.
• A frase latina do letreiro “Regnare Christus volumus!” foi tomada do ponto 11 do livro Caminho e significa: “Queremos que Cristo reine!”.